日本留学签证抽查主要有电话调查和实地调查两种方式，以下是具体介绍：
电话调查
调查对象
学生本人 ：询问留学目的、日语能力、学习计划、对学校和专业的了解等。比如为何选择日本留学、在日学习期间的具体规划、毕业后的打算等。
经费支付人 ：通常是学生的父母或其他法定监护人，主要核实经济状况和与学生的关系，如收入情况、工作单位、是否愿意及有能力支付学生留学费用等。
经费支付人单位 ：确认经费支付人在职情况、收入是否属实等，像询问该人员是否在本单位工作、担任什么职务、工资水平等。
调查内容
日语能力 ：测试学生的日语听说读写能力，判断是否与提交的日语能力证明相符，可能让学生用日语进行简单对话、介绍自己、描述留学计划等。
材料真实性 ：核对申请材料中的信息，如学历证明、成绩单、在职证明、资金证明等是否真实，可能询问学校名称、毕业时间、成绩具体情况、单位地址和电话等。
留学动机和规划 ：了解学生赴日留学的动机是否纯正，是否有明确的学习目标和规划，例如问学生对所选专业的兴趣点、未来职业规划与留学专业的关联等。
调查概率
领区差异 ：沈阳领馆领区电话调查概率较高，东三省同学需特别注意；北京使馆领区今年 4 月起变严，对流水检查重视，电话调查概率高于其他部分地区；广州和上海使馆领区相对宽松，电话调查较少，但广州领区内福建地区因历史原因，审查会严格些；青岛和重庆领馆区处于中等水平，偶尔会进行电话调查。
个人情况 ：大龄、毕业年限长的人，专科或本科专业为日语但没有日语等级证的人，户籍为福建地区的申请者（学历高、工作稳定者除外），这些人群被电话调查的概率相对较高。
实地调查
日本入管局可能会派人到学生的毕业学校、经费支付人工作单位或家庭住址等地进行实地核实 。核实内容包括：
毕业学校 ：确认学生是否真实毕业于该校，学历证书、成绩单等材料的真实性，还可能与学校老师、同学交流，了解学生在校期间的表现和学习情况。
经费支付人工作单位 ：查看单位是否真实存在，经费支付人是否确实在此工作，收入证明等材料是否与实际相符。
家庭住址 ：确认家庭地址是否真实，家庭生活状况是否与申请材料中体现的经济情况相符等，比如观察居住环境、家庭设施等，侧面了解家庭经济实力。