通常情况下，初中学生当兵保留的学籍是可以取消的，但需要遵循一定的程序和规定。一般有以下两种方式：
- 办理休学：如果学生只是暂时不想保留学籍，但未来还有可能继续学业，可以选择办理休学。家长或学生本人可以直接到学校办理休学手续，通常需要提交相关申请材料，说明休学原因等情况。这种情况下，退伍后还可再办理复学手续。
- 办理退学：若学生及其家长经过慎重考虑，确定不再继续学业，可以选择办理退学手续来取消学籍。需直接到学校相关部门（如教务处等）办理退学手续，一般要提交退学申请等材料，经学校审核批准后，即可取消学籍。不过，退学后就不可再办理复学了。