日本留学学费的缴纳方式主要有以下几种：
银行汇款
- 国内银行柜台汇款：准备学校提供的详细汇款信息，包括银行名称、账号、收款人姓名等，前往国内银行柜台办理国际汇款手续，填写汇款单并提交相关材料，缴纳汇款手续费，一般在200-300元左右。完成汇款后，保留好汇款凭证，并按照学校要求将凭证寄送给学校或通过邮件等方式提供给学校用于确认收款。
- 网上银行或手机银行汇款：登录国内银行的网上银行或手机银行APP，找到国际汇款相关功能模块，按照提示填写学校的汇款信息和汇款金额等内容，确认无误后进行支付。部分银行可能还需要进行安全验证，如输入短信验证码、U盾密码等。这种方式操作便捷，可随时办理，且手续费可能相对柜台汇款略低。
在线支付平台
- 支付宝：在支付宝搜索“留学缴费”，输入需要缴费的学校名称，填写学费金额，上传缴费通知单和学生身份证明，创建订单后，在收银台选择【银行转账付款】即可完成支付，通常3分钟左右就能完成缴费，最快一小时到账。
- 微信：微信专门开通了境外支付学费的新平台，可通过小程序，用微信里面的人民币直接打款到学校指定的银行账户。
- 其他国际支付平台：如PayPal等国际知名支付平台也广泛应用于全球范围内的留学费用支付，只需在支付平台上注册账户，并绑定银行卡或信用卡，即可通过手机或电脑完成支付。
信用卡支付
部分日本学校接受国际信用卡支付学费，如Visa、MasterCard等。留学生只需在学校指定的支付平台或系统中输入信用卡信息，包括卡号、有效期、安全码等，即可完成支付。但使用信用卡支付可能会有额外的手续费，一般在3%左右，还可能会有汇率损失。
邮局汇款
部分学校也接受通过邮局汇款的方式缴纳学费。留学生需要到当地邮局填写汇款单，提供学校的收款信息，包括收款人姓名、地址、账号等，以及汇款金额和相关手续费。邮局会提供汇款回执，作为汇款凭证，需要妥善保存。
留学中介代缴
如果通过留学中介申请日本留学，一些中介会提供代缴学费的服务。学生将所需款项交给留学中介，并提供学校的缴费要求和相关信息，中介会代为办理汇款等手续，确保资金安全到达学校账户。
学校现场缴费
在某些情况下，学生抵达日本后，也可以选择在学校指定的时间和地点，使用现金、支票或日本当地的银行转账等方式缴纳学费。但这种方式相对较少见，且可能需要学生提前准备好足够的现金或在日本当地办理好相关银行账户和转账手续。