鲁迅是通过官费派遣的方式去日本留学的，具体过程如下：
- 选拔与派遣：1902年1月，鲁迅从南京矿路学堂毕业，他是被两江总督选派到日本留学深造的，当时具体操办此事的是陆师学堂总办俞明震。
- 同行人员：俞明震带领包括鲁迅在内的陆师学堂毕业生22名、矿务学生6名以及随行人员等一同前往日本。这6名矿务学生分别是徐广铸、顾琅、周树人（鲁迅）、张邦华、刘乃弼、伍崇学。
- 行程路线：1902年3月24日，鲁迅等人乘日本轮船大贞丸从南京出发，到上海换乘海轮神户丸东渡日本。4月4日抵达横滨，4月7日到达东京。
- 留学经历：鲁迅到达东京后，本准备进成城学校学习军事，但因“矿务学生”身份，并非学军事出身而遭到拒绝。后经清国公使蔡钧致函日本外务大臣，鲁迅等人于4月20日进入弘文学院学习日语和基础科目。1904年9月，鲁迅来到仙台医学专门学校（东北大学前身）学习，1906年弃医从文回到东京，把学籍挂在了德国文学协会附属德语专修学校（现在的独协大学），一边学习德语，一边进行文学创作。