日本留学申请公费主要有日本政府（文部科学省）奖学金、日本学生支援机构（JASSO）奖学金等途径，以下是具体申请方式：
日本政府（文部科学省）奖学金
大使馆推荐
确认项目 ：登录各国大使馆主页，确认是否有所需种类和领域的招生项目，也可直接向日本大使馆咨询。
提交材料 ：按要求准备并向大使馆提交必要文件。
参加面试 ：大使馆组织面试等选拔环节。
等待结果 ：大使馆将选拔结果推荐给文部科学省，等待最终审核结果。
大学推荐
确认学校资格 ：确认志愿报考的日本大学是否有推荐名额，一般被文部科学省承认的大学才有资格。
学校选拔 ：目标大学开展自身选拔，对学生的成绩、综合素质等进行评估。
大学推荐 ：大学将认为优秀的学生推荐给文部科学省。
等待审核 ：文部科学省对推荐学生进行审核，确定最终合格者。
日本学生支援机构（JASSO）奖学金
赴日前 / 报考大学前申请
参加 EJU ：在日本留学考试（EJU）中取得优异成绩，在报考 EJU 时，在 “接收留学生促进计划” 栏中表明 “申请奖学金”。
学校推荐 ：被选为预约者的学生在指定期限内就读目标学校后，由学校向日本学生支援机构推荐。
机构批准 ：日本学生支援机构审核批准后，学生获得学习奖励费。
赴日后 / 报考大学后申请
确认资格 ：确认自己是否符合申请对象要求，如在日本的研究生院作为研究生或正规学生在籍等。
满足条件 ：满足成绩评估系数、日语及英语能力、生活费标准等要求。
学校申请 ：向就读学校负责人咨询并提交申请，由学校推荐给日本学生支援机构。
地方自治体 / 相关国际交流团体奖学金
了解信息 ：查询自己所在地或目标学校所在地的相关奖学金信息，明确申请条件，如是否限定居住地、学校等。
准备材料 ：按要求准备申请材料。
提交申请 ：学生本人向日本地方政府或直接向发放团体提交申请。
民间奖学金团体奖学金
查找项目 ：了解民间企业或民间奖学团体设立的奖学金项目，通常会限定特定学校、专业或特定国家和地区出身的学生。
满足条件 ：符合项目设定的专业、成绩等限定条件。
提交申请 ：可以自己向学校申请或直接向发放团体申请。
学校独自设立的奖学金
关注信息 ：留意学校入学说明会及官网信息，了解学校设立的奖学金项目及申请要求。
准备申请 ：按照学校要求准备材料，可能包括成绩单、推荐信、个人陈述等。
提交审核 ：向学校提交申请，等待学校审核评定。