日本公费留学后想留在日本，有以下几种常见方式：
就业留日
- 毕业后直接找工作：日本政府为方便留学生毕业后找工作，会提供最长6个月的短期签证。留学生可在毕业前到入国管理局申请3个月的“短期滞在”签证用于找工作，若在此期间拿到公司录取通知书，就可申请工作签证。若3个月内未找到工作，可凭借毕业学校的推荐信再申请3个月用于就职活动的“短期滞在”签证。
- 通过专门学校过渡：日本的专门学校一般是二年制，可授予“专门士（Diploma）”称号，主要教授职业技能，接受0基础申请者，日语达到N2水平即可申请，其学历在日本就业社会中有较高的认可度，毕业后可凭借所学专业技能找工作，进而获得工作签证留在日本。
- 利用语言学校的就职辅导：部分日本语言学校设有就职辅导课程，包括商务日语课程、职业技能类课程等，还会提供求职支援，帮助学生提升求职能力，增加在日本就业的机会，之后同样可申请工作签证留日。
继续升学
本科毕业后可以继续考修士，修士毕业后在日本就业市场上会有更多的选择和更高的竞争力，从而更容易获得工作签证留在日本。当然也可以选择继续攻读博士学位，毕业后无论是在学术领域还是企业研发等部门都可能有较好的发展机会，进而实现留日。
结婚留日
与拥有日本永驻身份或者是日本国籍的人结婚，就可以办理相应的签证留在日本。不过这种方式下签证的稳定性取决于双方感情状况。若配偶是就职签证，也可办理家族滞在签证，但配偶一旦失业，两人可能就会失去在日滞留的签证。
投资经营留日
可以申请投资经营签证，通过在日本投资创业等方式来获得在日居留资格。不过这种方式需要有较好的投资项目和一定的资金实力，因为要承担房租、税金、工资等开支，如果经营不善连续出现赤字，可能会面临签证无法续签的情况。
申请永驻或入籍
- 申请永驻：在日本持续工作5年以上，且连续在日本居住满10年，有足够的财产或技能能养活自己或家庭，无违法犯罪行为，按时纳税、缴纳年金、公共医疗保险费等费用，就可以申请永驻签证。另外，日本有高级人才积分制度，达到70分的申请者，在日本连续居住3年，并在申请之日三年前依照积分表被认定70分以上，可申请永驻；达到80分的申请者，连续居住1年，并在申请之日一年前被认定80分以上即可申请。
- 申请入籍：一般在日本居住满5年以上，有稳定的收入来源，遵守日本法律，无犯罪记录，能够融入日本社会等，就可以申请加入日本国籍。